Um nochmal was zu dem Thema BIOS und PCI Ressourcen zu sagen, ich habe gerade mal auf meinem Sockel 940 (Opteron) Board im BIOS nachgeguckt und da steht als Erklärung für die genannte Option (Plug&Play OS available) das nur die Ressourcen initialisiert werden, die zum Booten nötig sind.
Damit kann man mit 100%er Sicherheit davon ausgehen, das auch Windows sowas beherrscht!