COMMAND.COM ist die Befehlszeile von DOS und damit ein 16Bit Programm.
cmd.exe ist ein 32Bit Programm für Windows NT und bildet einige Befehle von COMMAND.COM nach. Das heißt aber nicht das cmd.exe ein DOS ist - ist es nämlich nicht.
Die Stapelverarbeitung läuft mit der cmd.exe, also auch nicht in einem MSDOS-Subsystem.
Das einzige im MSDOS Subsystem sind 16Bit Programme (alte Spiele etc.).
In den 64Bit Versionen von Windoof gibt es AFAIK gar kein DOS-Subsystem mehr und ab Vista ist das auch in der 32Bit Version eingeschränkt (z.B. geht der Vollbildmodus nicht mehr).
Bei XP gibt es COMMAND.COM AFAIK übrigens noch - frag mich aber jetzt bitte nicht wo
Edit: gib in cmd.exe mal COMMAND.COM ein
Grüße,
LittleFox