Hallo
Also ich verwende selber Eclipse CDT. Am Besten erstellt Du ein Projekt mit (bestehender) Makefile und kompilierst (logischerweise mit Linkerskript)
1.) Codeordner mit Makefile erstellen (Eigentlich logisch ..)
2.) New -> Makefile Project with Existing Code
3.) Codeordner auswählen
4.) Ordner anwählen und Shift+F9
5.) Ein "Create-Label" erstellen, am Besten dieses so nennen, wie in der Makefile, dann musste nichts mehr ändern, da das Label übernommen wird
6.) Label auswäheln und kompilieren
Gruss